Чистый Четверг народное название Великого Четверга Страстной седмицы.

В этот день Церковь вспоминает важнейшее евангельское событие: Тайную вечерю на которой Христос установил новозаветное таинство Святого Причащения Евхаристии. В современном же смысле Чистый Четверг не потому именуется Чистым что в этот день делают баню а потому что люди приходят исповедуются и причащаются.
То есть эпитет чистый в словосочетании Чистый Четверг понимается в переносном смысле как акцент на духовном очищении.
Впрочем гигиенические процедуры обычное купаниеомовение также вполне уместны разве что не нужно считать их главной целью настоящего дня.

Источник: rutube.ru