Действие игры происходит примерно через 20 лет после событий первой части по подсчётам фанатов.
G-Man пробуждает Гордона Фримена из стазиса и перемещает в поезд идущий в Сити 17 город в Восточной Европе.
Сразу же становится понятно что Земля захвачена инопланетной цивилизацией именуемой Альянсом а управляет человечеством некий Уоллес Брин как позже выяснится бывший администратор исследовательского центра Чёрная Меза.
На вокзале Барни в прошлом охранник Чёрной Мезы и друг Гордона спасает его от участи быть пойманным Гражданской Обороной.
Он направляет его в лабораторию доктора Кляйнера.
ГО устраивает облаву на Гордона и в конце концов оглушает его но учёного выручает девушка по имени Аликс дочь коллеги Фримена по Чёрной Мезе Илая Вэнса и отводит в лабораторию где Гордону выдают обновлённый костюм H.E.V.
Далее Аликс телепортируют в Восточную Чёрную Мезу подпольную базу Сопротивления.
Гордона также собираются телепортировать на базу но всё срывает Ламарр ручной хедкраб Кляйнера.
Гордон переносится на задний двор Барни кидает ему монтировку и герой начинает своё путешествие через каналы.
HalfLife2
Источник: rutube.ru